20世紀(jì)80年代初，以追趕世界一流科技水平為目標(biāo)，原國(guó)家計(jì)委啟動(dòng)了“國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)計(jì)劃”。

1982年—1991年，國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室承擔(dān)了國(guó)家五年計(jì)劃攻關(guān)任務(wù)，并獲得了相應(yīng)的政策和資源支撐。截至1991年，全國(guó)共建立了近40個(gè)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，分布在7個(gè)學(xué)科領(lǐng)域。

1992年—2002年，國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在評(píng)估中不斷調(diào)整。2002年4月，科技部印發(fā)《國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)與管理暫行辦法》，對(duì)規(guī)范國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的建設(shè)和運(yùn)行管理發(fā)揮了重要作用。

2003年—2013年，國(guó)家在嚴(yán)格評(píng)估的同時(shí)加大了對(duì)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的支持力度，國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)入競(jìng)爭(zhēng)擴(kuò)建階段，陸續(xù)增設(shè)了港澳國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、企業(yè)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室等多種類型。

2014年，國(guó)務(wù)院印發(fā)《關(guān)于深化中央財(cái)政科技計(jì)劃（專項(xiàng)、基金等）管理改革方案的通知》，提出對(duì)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室等國(guó)家級(jí)科技力量進(jìn)行合理歸并，進(jìn)一步優(yōu)化布局。

2017年，科技部、財(cái)政部、國(guó)家發(fā)改委聯(lián)合印發(fā)《國(guó)家科技創(chuàng)新基地優(yōu)化整合方案》，提出重新統(tǒng)籌布局國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。

2022年2月，科技部辦公廳印發(fā)《關(guān)于貫徹落實(shí)<重組國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室體系方案>的通知》，提出了《全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)(試行)》和《全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)“五問”》，開啟全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室優(yōu)化重組。

2022年5月，全國(guó)首批20家標(biāo)桿全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室完成重組，名稱中的“國(guó)家重點(diǎn)”全部改成了“全國(guó)重點(diǎn)”。