1965年9月-1968年6月，就讀于北京醫(yī)科大學，畢業(yè)后獲得生物化學專業(yè)碩士學位。
1978年9月-1982年6月，就讀于日本北海道大學，畢業(yè)后獲得醫(yī)學專業(yè)博士學位。
1982年-1990年，任哈爾濱醫(yī)科大學教授、副校長。
1990年-1992年，任中國駐日本大使館教育參贊。
1992年-2002年，歷任中國醫(yī)學科學院院長，中國協(xié)和醫(yī)科大學校長。
1994年，當選為中國工程院院士。
1999年，當選為美國國家醫(yī)學院外籍院士。
2003年-2009年，任浙江大學醫(yī)學院院長。
2009年，任浙江大學醫(yī)學院名譽院長。
2019年，當選為中國醫(yī)學科學院學術咨詢委員會學部委員。
《當代免疫學技術與應用》《當代醫(yī)學新理論與新技術叢書》等
《就任紀念特別學術講演》《面向21世紀的中國高等醫(yī)學教育》《醫(yī)學科技的發(fā)展趨勢和我們的發(fā)展戰(zhàn)略》《改革醫(yī)學學位類型 加速高層次人才培養(yǎng)》《我國醫(yī)學教育的機遇與挑戰(zhàn)——對當前醫(yī)學教育的反思與建議》《借鑒美國醫(yī)學教育 培養(yǎng)卓越醫(yī)學人才》《健康是國民第一素質(zhì)》等
《腫瘤免疫的重點課題和主要趨向》《緩慢釋放載體PLF-127的研究——對特定的生物學反應調(diào)節(jié)劑（BRM）抗腫瘤作用的增強》《治療癌癥的一個新途徑——LAK療法》《在人的不同轉(zhuǎn)移性肺腺癌細胞中癌基因在DNA和mRNA水平上的比較研究》《淋巴/細胞因子研究與臨床應用》《人CD3AK細胞殺傷人肺腺癌細胞的形態(tài)學觀察》等
20世紀80年代初，巴德年在世界上首次發(fā)現(xiàn)抗胸腺自家抗體，從而為高血壓大鼠的免疫功能低下找到了原因。在國際上首次提出免疫功能異常與高血壓發(fā)生的關系；在中國國內(nèi)率先開展了LAK細胞的研究，并將LAK療法用于臨床并在防止癌轉(zhuǎn)移方面取得效果。
在央視“朝聞天下”欄目報道北京協(xié)和醫(yī)學院“4+4”教育模式創(chuàng)新培養(yǎng)優(yōu)秀醫(yī)學人才的實踐的活動中，巴德年主張：“教育是在為明天、后天培養(yǎng)人才，必須往遠處看。要給學生更多思考空間，培養(yǎng)他們自我學習的能力，從而激發(fā)創(chuàng)造性。要讓最好的學生選擇學醫(yī)，將來讓最好的醫(yī)學生成為最好的醫(yī)生。所謂大醫(yī)學教育，就是培養(yǎng)既懂公共衛(wèi)生知識，又有扎實臨床基礎知識，在工作中懂預防、會看病、能和患者良好溝通交流的好醫(yī)生。正確理解醫(yī)學的本質(zhì)和醫(yī)學的目的，對醫(yī)學教育至關重要?？茖W求‘真’，人文講‘善’，藝術要‘美’。而醫(yī)學是自然科學與人文科學的統(tǒng)一，是科學與藝術的完美結(jié)合。
隨著醫(yī)學科學的發(fā)展，考慮到應與世界護理教育接軌，巴德年提出成立護理學院的設想。1993年11月11日，經(jīng)院校長辦公會議研究，同意成立中國協(xié)和醫(yī)科大學護理學院。1994年初，經(jīng)向衛(wèi)生部報告，擬將中國協(xié)和醫(yī)科大學護理系和中國醫(yī)學科學院衛(wèi)生學校合并改為中國協(xié)和醫(yī)科大學護理學院。1995年9月11日，衛(wèi)生部批復同意將中國協(xié)和醫(yī)科大學“臨床部、基礎部、護理系”分別改為“臨床學院、基礎醫(yī)學院、護理學院”。1996年1月24日，中國協(xié)和醫(yī)科大學護理系和中國醫(yī)學科學院衛(wèi)生學校合并成立中國協(xié)和醫(yī)科大學護理學院。2007年5月18日，中國協(xié)和醫(yī)科大學護理學院啟用“北京協(xié)和醫(yī)學院護理學院”名稱。
1997年，獲北美華人生命科學成就獎。
1998年，獲美國中華醫(yī)學基金會醫(yī)學（CMB）杰出貢獻獎。
2008年，被衛(wèi)生部列為“健康中國2020”戰(zhàn)略規(guī)劃首席專家。
2004年，被評為浙江大學“三育人標兵”。
2005年，浙江大學創(chuàng)辦以醫(yī)學院院長巴德年名字命名的“巴德年醫(yī)學班”。
2006年，巴德年獲中國工程院光華科技工程獎。
2007年，獲香港中國杰出學人獎。
“巴德年是中國國微生物療法的帶頭人之一?！保ā抖际锌靾蟆吩u）
“巴德年是中國免疫學領域的泰斗，學界大師，癌生物療法的學術帶頭人之一。”（網(wǎng)易網(wǎng)評）
“巴德年心系國家發(fā)展，多次為中國醫(yī)藥衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展建言獻策；在中國工程院戰(zhàn)略咨詢、學術引領等方面發(fā)揮了重要作用；他熱愛祖國、胸懷人民、嚴謹治學、開拓創(chuàng)新、敬業(yè)奉獻、為人師表，為促進中國高層次醫(yī)學人才培養(yǎng)體系的形成做出了重要的貢獻，是中國工程科技界的楷模和學習的榜樣?！保ǖV山安全技術專家李曉紅院士評）
中國十大生命科學領軍人物 NO.4
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