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臺北醫(yī)學大學原名臺北醫(yī)學院，創(chuàng)立于1960年6月1日，是醫(yī)學專家暨熱心醫(yī)藥教育人士胡水旺先生與徐千田先生等所捐資創(chuàng)設。創(chuàng)校之初，校地盡是一片荒蕪水田，教學與研究資源匱乏，四十八年來，在歷屆校長的努力下，從創(chuàng)校之三學系二專科，擴展為現有醫(yī)學院、口腔醫(yī)學院、藥學院、護理學院、公共衛(wèi)生暨營養(yǎng)學院五個學院，十三學系及十三研究所之規(guī)模。自從2000年改名臺北醫(yī)學大學以來，便一直以成為國際一流醫(yī)學大學為目標，持續(xù)努力。

在教學方面，作為一所都會型醫(yī)學專業(yè)大學，臺北醫(yī)學大學的教育理念，在于教導學生醫(yī)學專業(yè)知識之外，同時重視博雅教育，回歸以人為本的教學。在這樣的理念上，自2006年起，連續(xù)三年獲得教育部教學卓越計劃補助，獲得肯定。為落實該校結合醫(yī)學科技與人文教育的理想，深化人文與通識教育，學校以專業(yè)教育通識化、通識教育專業(yè)化為兩大主軸，持續(xù)貫徹教學品質與績效的目標。

在研究方面，頂尖研究是國際一流大學不可或缺之一環(huán)，臺北醫(yī)學大學過去幾年來，研究水準已有長足的進步。為持續(xù)朝向世界前五百大頂尖大學，學校順應國際趨勢，極力爭取大型及整合型研究計劃，延攬國內外杰出人才及其團隊，提高研究獎勵，并建立與國際一流研究單位合作關系。

在醫(yī)療方面，隨著教學研究的成長，該校醫(yī)療體系也日漸茁壯。臺北醫(yī)學大學擁有附設醫(yī)院、萬芳醫(yī)院、雙和醫(yī)院，三所附屬醫(yī)院，近三千床之規(guī)模，是為臺北地區(qū)醫(yī)學院校最大之醫(yī)療體系。臺北醫(yī)學大學統合學校及三附屬醫(yī)院的資源，在見、實習與臨床技能訓練上，具有完整的設備與空間，更以服務鄰近社區(qū)，保障國人健康為職志。

洪奇昌：民主進步黨立法委員

林益世：國民黨立法委員

侯文詠：麻醉醫(yī)師、知名作家

張洪量：牙醫(yī)系畢業(yè)，流行音樂歌手、制作人

隆中隱：知名中國音樂教育者

陳以生：牙醫(yī)系學士、口研所碩士，流行音樂歌手

陳子忠：醫(yī)技系學士、中港臺醫(yī)療管理人員

李良雄：臺北榮民總醫(yī)院院長

1958年，創(chuàng)辦人胡水旺先生、徐千田先生籌設北醫(yī)。

1960年，北醫(yī)創(chuàng)立，當時有醫(yī)學系、牙醫(yī)學系及藥學系三系。

1963年，成立護理助產專修科，招收五專生。

1965年，成立醫(yī)事技術專修科，招收五專生。

1975年，醫(yī)事技術專修科改制為醫(yī)事技術學系。

1976年，設立臺北醫(yī)學大學附設醫(yī)院。

1977年，護理助產專修科改制為護理學系。

1979年，成立保健營養(yǎng)學系。

1989年，成立公共衛(wèi)生學系。

1989年，成立天然物醫(yī)學研究所。

1990年，胡俊弘先生接任校長，成立醫(yī)學研究所。

1992年，成立口腔復健醫(yī)學研究所。

1993年，口腔復健醫(yī)學研究所改名為牙醫(yī)學研究所。天然物醫(yī)學研究所改名為醫(yī)學研究所。

1994年，成立細胞及分子生物研究所。領先全國各校成立「醫(yī)學資訊暨電子計算機中心」。

1995年，成立保健營養(yǎng)學研究所碩士班。護理學研究所碩士班。

1996年，接收臺北市政府委托經營市立萬芳醫(yī)院。

1997年，成立醫(yī)務管理學系。

1998年，成立生物醫(yī)學技術研究所、醫(yī)學資訊研究所。

1999年，成立生藥技術學系，是臺灣第一個中藥相關學系。由當時藥學院院長楊玲玲教授所創(chuàng)立,但由於藥師全聯會的反對,迫使2007年停止招生。

2000年，改名「臺北醫(yī)學大學」，成立醫(yī)務管理研究所、生物醫(yī)學材料研究所。

2001年，成立呼吸治療學系、口腔衛(wèi)生學系。

2002年，成立藥理學研究所、口腔科學研究所、保健營養(yǎng)研究所博士班。

2003年，通過衛(wèi)生署甄選，籌建雙和醫(yī)院，并成立醫(yī)學人文研究所。

2004年，成立神經科學研究所。

2006年，口腔科學研究所與生醫(yī)材料研究所合并，改名為生醫(yī)材料暨工程研究所。護理學研究所博士班成立、醫(yī)事技術學系改名為醫(yī)學檢驗暨生物技術學系。

2007年，成立牙體技術學系、老人護理暨管理學系。由原先的醫(yī)學研究所基礎組、細胞及分子生物研究所、醫(yī)學檢驗暨生物技術學系碩士班、藥理學研究所及神經科學研究所五所整合為醫(yī)學科學研究所。

2008年，附屬醫(yī)院-雙和醫(yī)院於7月1日開始營運、邱文達教授接任校長

2009年，醫(yī)務管理學系并入公共衛(wèi)生暨營養(yǎng)學院，開始招收碩士班國際學生。

2010年，成立醫(yī)學科技學院、人文暨社會科學院。

2011年，榮獲QS亞洲頂尖大學前百大。連續(xù)六年獲教育部補助近4億元。

2011年，邱文達校長榮陞衛(wèi)生署署長，閻云教授接任北醫(yī)第九任校長。

2013年，老人護理暨管理學系更名為高齡健康管理學系。

2014年，藥學系分設藥學組、臨床藥學組。

2015年，成立管理學院，并將公共衛(wèi)生暨營養(yǎng)學院中的「醫(yī)務管理學系（學士班、碩士班、碩士在職專班）」整并至管理學院。

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